Table des matières
Partie 1 : Introduction générale : Théorie de la taxonomie 1
Chapitre 1 : Qu’est-ce que la taxonomie ? 3
Chapitre 2 : Reconnaissance des traits de classification 13
Chapitre 3 Dénomination : Nomenclature 23
Chapitre 4 : Comportement grégaire : Classification 43
Chapitre 5 : Déterminer la lignée des êtres vivants 51
Chapitre 6 : Évolutions de la taxonomie biologique 71
Chapitre 7 : Chronologie de la Terre : L'émergence des différentes formes de vie 91
Partie 2 : Introduction générale : Biodiversité 105
Chapitre 8 : Bactéries, archées et virus 109
Chapitre 9 Domaine eucaryote : protistes, champignons et lichens 119
Chapitre 10 : Domaine eucaryote : Règne Plantae 139
Chapitre 11 : Domaine eucaryote : Règne animal 185
Référence 232
Annexe : Exemple d’expérience de taxonomie axée sur les plantes (pour le semestre 1) 235
Recherche 277



Partie 1 : Introduction générale : Théorie de la taxonomie 1

Chapitre 1 : Qu’est-ce que la taxonomie ? 3
1.1 Pourquoi organiser : l’objectif de la classification 3
Gestion des fichiers informatiques 4
Vêtements 4
Échantillon 5
Biologie 5
1.2 Éléments nécessaires à l'organisation : 6 composantes de la classification
1.3 Taxonomie : L'étude du classement et de l'organisation 7
1.4 Erreurs dans l'enseignement de la taxonomie 8
Essayez-le 8
En savoir plus 8
Pensée 9
Référence 10

Chapitre 2 : Reconnaissance des traits de classification 13
2.1 Caractéristiques des êtres vivants 14
2.2 Caractères utilisés dans la classification animale 14
Niveau 14 du système corporel animal
Symétrie 14
Niveaux de développement animal : Développement du plan corporel animal 16
Le destin de Won-gu 17
Segmentation 18
Autres caractéristiques 18
2.3 Caractères utilisés dans la classification des plantes 19
Caractéristiques morphologiques 19
Caractéristiques anatomiques 20
Méthode de reproduction 21
Autres caractéristiques 21

Chapitre 3 Dénomination : Nomenclature 23
3.1 Comment nommer une personne 23
3.2 Nommer les êtres vivants 24
3.3 Nomenclature 24
La nécessité des noms scientifiques 24
Nomenclature des êtres vivants 24
Qu'est-ce que le papier ? 27
Composition des noms scientifiques 30
Changement de nom 31
Citation de l'auteur 32
Confirmation du nom 32
3.4 Définition de l'échantillon de référence 33
3.5 Nouvelle annonce 33
3.6 Code international de nomenclature 34
Code international de nomenclature zoologique (CINZ) 34
Code international de nomenclature des algues, des champignons et des plantes (ICN) 34
Essayez-le 35
En savoir plus 39
Pensée 41

Chapitre 4 : Comportement grégaire : Classification 43
4.1 Comment constituer un groupe : Critères de classification 44
4.2 Étapes de classification (classes) 45
4.3 Table de consultation 46
Essayez 50
Pensez à 50

Chapitre 5 : Trouver l'arbre généalogique des êtres vivants 51
5.1 Analyse des caractères pour l'analyse phylogénétique 52
Sélection des traits 52
Critères d'homologie et d'analogie 53
Direction 53
5.2 Méthodologie I : Analyse type 54
Exemple 54 d'une analyse de traits typique
5.3 Méthodologie II : Analyse des limites 56
Hypothèse 56 de l'analyse des limites
Détermination des types primitifs et dérivés d'états de caractères 57
1er critère 57
Critères secondaires 59
60. Préparation d'un cladogramme (cladogramme)
5.4 Méthodologie III : Phylogénétique moléculaire 62
Loi de distance 62
Moyenne non pondérée combinée 62
Loi sur les liens de voisinage 63
Méthode discrète 63
Méthode d'épargne maximale 63
Méthode du maximum de vraisemblance 65
Inférence bayésienne 66
Essayez-le 67
En savoir plus 69
Problème 70

Chapitre 6 : Évolutions de la taxonomie biologique 71
6.1 Développement des systèmes de classification biologique 71
Système de second niveau 71
Système à trois niveaux 72
Deuxième Empire, Quatrième Système, 72
Système à cinq niveaux 72
Système à six niveaux 72
Système à 3 stations 74
Système à 3 stations et 6 niveaux 75
Système à sept niveaux 75
Le système de classification biologique de notre pays 75
Système de classification biologique 75
6.2 Évolution de l'arbre biologique 78
6.3 Arbre phylogénétique actuel 83
Arbre de Vie Universel 84
Arbre phylogénétique des organismes appartenant au phylum bactérien 84
Arbre phylogénétique des organismes appartenant au genre Archaebacteria 85
Les organismes appartenant au domaine des eucaryotes figurent dans l'arbre phylogénétique 86
Arbre phylogénétique des organismes appartenant au règne des champignons 87
Arbre phylogénétique des organismes appartenant au règne végétal (plantes terrestres) 87
Arbre phylogénétique des créatures appartenant au règne animal 87
Penser 90

Chapitre 7 : Chronologie de la Terre : L'émergence des différentes formes de vie 91
7.1 La Naissance de la Terre 92
7.2 Précambrien 92
La Naissance de la Vie 92
L'origine et l'évolution des procaryotes : bactéries et archées 95
La naissance des eucaryotes : il y a 2,2 milliards d’années 96
7.3 Ère paléozoïque 98
Cambrien (il y a 542 millions d'années) : La grande explosion des animaux marins 98
Ordovicien (il y a 488 millions d'années) : Les plantes colonisent les terres 98
Silurien (il y a 444 millions d'années) :
Diversification des premières plantes vasculaires 99
Dévonien (il y a 416 millions d'années) : Diversification des poissons osseux, apparition des tétrapodes et des insectes 99
Carbonifère (il y a 359 millions d'années) : Prolifération des fougères, apparition des plantes à graines et des reptiles.
Permien (il y a 299 millions d'années) : 100 extinctions massives
7.4 Ère mésozoïque 100
Période triasique (il y a 251 millions d'années) : L'essor des conifères et des fougères, l'apparition des oiseaux et l'extinction massive de 100 espèces.
Jurassique (il y a 200 millions d'années) : Les gymnospermes dominent, une grande diversité de dinosaures apparaît.
Crétacé (il y a 146 millions d'années) : Apparition des plantes à fleurs, extinction massive de 100 espèces
7.5 Ère Cénozoïque 101
Période tertiaire (il y a 65,5 millions d'années) : Radiation des insectes et des mammifères, origine des primates 101
Période quaternaire (il y a 1,8 million d'années) : Les ères glaciaires répétées (niveau 1)
En savoir plus 101
Pensée 103
Résumé 104

Partie 2 : Introduction générale : Biodiversité 105

Chapitre 8 Bactéries, archées et virus 109
8.1 Domaine Bactéries 109
Caractéristiques des bactéries 110
111 caractéristiques clés utilisées en taxonomie bactérienne
Classification des bactéries 111
Protéobactéries 111
Chlamydia 112
Spirochète 112
Bactéries Gram-positives 112
Cyanobactéries 113
8.2 Domaine Archaea 113
Creonomyces 113
Euryarchaeota 114
8.3 Virus 115
En savoir plus 117

Chapitre 9 Domaine eucaryote : protistes, champignons et lichens 119
9.1 Règne Protista 121
Excavata 122
Diplomonades 123
Rétention parabasale (Parabasala) 123
Euglenozoa 123
Alvéolée 124
Dinoflagellé 124
P.
Apicomplexa) 124
Ciliés (P.
Ciliophora) 124
Straménopile 125
Diatomées (D.
Bacillariophyta, Diatomées ; cheval de pierre) 125
Algues brunes (D.
Phaeophyta) 125
P.
Rhizopoda) 126
Flagellés amibiens 126
Foraminifères 126
Radiolaires 126
Amoebozoa 126
Amibe 126
Amibe parasite 126
Myxomycètes 126
Algues rouges (D.
Rhodophyta) 127
Algues vertes (D.
Chlorophyta) 128
9.2 Règne des champignons 129
Cryptomycètes et
Microsporidies 131
D.
Chytridiomycota) 131
D.
Zoopagomycota) 131
D.
Mucoromycota) 131
Basidiomycètes (D.
Basidiomycètes) 132
Ascomycètes (D.
Ascomycètes) 132
9.3 Lichens 135
En savoir plus 137

Chapitre 10 : Domaine eucaryote : Règne Plantae 139
10.1 Bryophytes (Plantes non vasculaires) 140
Seonryumun (D.
Bryophytes) 141
Taeryumun (D.
Hepatophyta) 142
D.
Anthocerotophyta) 142
10.2 Plantes vasculaires 142
Lineamun (D.
Rhyniophyta) 143
Lycopodium (D.
Lycopodiophytes) 144
D.
Ptéridophytes) 145
D.
Equisetophyta) 145
D.
Psilotophyta) 145
D.
Polypodiophyta) 146
D.
Pinophyta) 149
rivière de ginkgos (C.
Ginkgoopsida) 150
Rivière Pine (C.
Pinopsida) 151
C.
Cycadopsida) 152
D.
Magnoliophyta) 155
Morphologie externe et terminologie des angiospermes 157
Rivière Magnolia (C.
Magnoliopsida) 165
Rivière Lily (C.
Liliopsida) 176
En savoir plus 182
Vérification 183

Chapitre 11 : Domaine eucaryote : Animalia 185
11.1 Éponges (P.
Porifères) 187
11.2 Cnidaires (P.
Cnidaires) 188
Hydrazoaires (C.
Hydrozoaires) 189
C.
Scyphozoaires) 189
Coralliformes (C.
Anthozoaires) 189
11.3 Plathelminthes (P.
Plathelminthes) 189
Wachunggang (C.
Turbellaria) 190
C.
Trématodes) 190
Jo Chung-gang (C.
Cestode) 190
11.4 Nématodes (P.
Nématodes) 192
11.5 Mollusques (P.
Mollusques) 192
C.
Gastropoda) 192
Bivalves (C.
Bivalves) 195
Céphalopodes (C.
Céphalopodes) 195
11.6 Vers annulaires (P.
Annélide) 198
Damogang (C.
Polychètes) 198
C.
Oligochètes) 198
Classe Sangsue (C.
Hirudinée) 200
11.7 Arthropodes (P.
Arthropodes) 200
Sous-embranchement de la sous-famille du genre ...
Chelicerata) 201
C.
Arachnides) 201
Daziamun (SP.
Myriapodes) 201
C.
Chilopoda) 201
Songgigang (C.
Diplopodes) 202
Sous-famille hexagonale (SP.
Hexapodes) 202
Insectes (C.
Insecta) 204
Crustacés (SP.
Crustacés) 207
11.8 Échinodermes (P.
Échinodermes) 211
C.
Astéroïdes) 211
Oursin (C.
Échinoïdes) 212
C.
Holothuroidea) 212
11.9 Chordés (P.
Chordata) 213
Sous-embranchement du genre Scutellaria (SP.
Urochordata) 213
Sous-embranchement des céphalocordés (SP.
Céphalocordés) 213
Vertébrés (SP.
Vertébrés) 213
Muaksanggang (SC.
Agnatha) 213
Esprits maléfiques (SC.
Gnathostomes) 213
SC.
Tétrapodes) 216

Résumé 230

Référence 232

supplément:
Exemple d'expérience de taxonomie axée sur les plantes (pour le semestre 1) 235
Semaine 1 Introduction à l'expérience 236
Semaine 2 : Comment nommer les plantes ? Observation et identification 240
Semaine 3 : Observation de Yuihwaseo 244
Semaine 4 : Observation et identification des gymnospermes et construction d'arbres phylogénétiques à partir de séquences d'ADN 248
Semaine 5 : Observation des fleurs et identification des familles à l’aide d’un mot-clé : Observation des fleurs 253
Semaine 6, Sortie scolaire 1 : Observation des plantes dans la cour de récréation 1 255
Semaine 7 : Observation des plantes de la famille des Rosacées et création d'une liste d'identification 256
Semaine 10 : Création d’arbres phylogénétiques à l’aide de logiciels de classification informatique 258
Semaine 11 : Observation et identification des plantes de la famille des Fagacées 271
Semaine 13 : Observation des graminées et des cypéracées 273
Semaine 14 : Observation des plantes de la famille des Astéracées : Comparaison des Astéracées et de leurs sous-familles 275

Recherche 277