Tout au long de l'histoire de la Terre, les micro-organismes ont existé bien avant l'apparition de l'homme.
C’est peut-être pourquoi les plantes, les animaux et les humains ne pourraient pas survivre sans micro-organismes.
Les microbes influencent non seulement la croissance des plantes, mais aussi l'humeur humaine.
On a progressivement découvert récemment que les microbes intestinaux influencent la production d'hormones qui affectent les émotions humaines.
On dit que lorsque les micro-organismes ne fonctionnent pas correctement, les humains deviennent émotionnellement sensibles et ont du mal à contrôler leurs émotions.
« Des bactéries qui sauvent, des bactéries qui tuent, des bactéries qui s’entraident » est le deuxième récit sur l’interaction entre les micro-organismes, les plantes et les animaux, raconté par le Dr Ryu Chung-min, qui a attiré l’attention de nombreux lecteurs avec son ouvrage précédent, « De bonnes bactéries, de mauvaises bactéries, d’étranges bactéries ».

La principale fonction des micro-organismes sur Terre est de décomposer la matière organique.
Comme il n'y a pas de micro-organismes sur Mars ou sur la Lune, les aliments jetés à la poubelle peuvent y rester indéfiniment.
C’est peut-être une bénédiction que la matière organique sur Terre se décompose et crée une odeur.
Dans l'écosystème terrestre, lorsque la matière organique se décompose et que du dioxyde de carbone est créé, les plantes effectuent la photosynthèse pour créer des sucres.
Lorsqu'un animal ingère cela, des micro-organismes le décomposent dans ses intestins.
Lorsque les animaux défèquent, les micro-organismes décomposent à nouveau ces matières fécales et recréent du dioxyde de carbone.
Que se passerait-il si l'on éliminait complètement les microbes de ce processus ? Il ne faut pas oublier que les microbes sont indispensables à une grande partie de la vie sur Terre.

--- p.17~18

L'une des expériences sur lesquelles je me suis concentrée après mon retour en Corée, une fois mon doctorat terminé, portait sur le fait que les plantes sécrètent une substance spéciale par leurs racines pour lutter contre les attaques d'insectes, attirant des micro-organismes bénéfiques capables de repousser les insectes.
Ces micro-organismes bénéfiques, attirés par les plantes, tuent directement les insectes ou renforcent l'immunité de la plante pour la protéger des attaques d'insectes.

--- p.75

Des recherches ont également montré que, plutôt que d'être causée par une maladie, la résistance au stress environnemental peut être due à la présence de micro-organismes dans le sol qui augmentent la résistance au stress environnemental dans la génération suivante.
Le sol se souvient précisément du stress subi par les plantes l'année dernière.
--- p.78

Les plantes libèrent 30 % du glucose qu'elles produisent par photosynthèse dans le sol par leurs racines.
Je ne comprends toujours pas bien pourquoi je fais une chose aussi inutile.
Les plantes sont des philanthropes autoproclamées qui se contentent de répandre sur le sol la nourriture qu'elles ont si durement produite.
Pourquoi cela a-t-il duré si longtemps ? La plupart des consommateurs de nutriments sont des micro-organismes situés à moins d’un millimètre des racines.
Ainsi, dans ce millimètre de profondeur, des micro-organismes parfaitement adaptés aux plantes ont appris à vivre ensemble.

--- p.80

Lorsque les plantes sont stressées et que des substances phénoliques sont libérées dans le sol, seuls les micro-organismes capables de les surmonter survivront et continueront d'interagir avec les plantes.
La raison pour laquelle les plantes choisissent ces endroits pour pousser à proximité est probablement que cela leur est avantageux.
Les interactions peuvent parfois ne profiter qu'à une seule partie, mais dans de nombreux cas, elles sont mutuellement bénéfiques.
Ainsi, la symbiose peut constituer un avantage considérable pour la survie des deux organismes.

--- p.83

Il est toujours fascinant de constater comment les plantes conservent des fragments de leur mémoire grâce aux micro-organismes présents dans le sol.
C'est comme si je contemplais un obélisque, sculpté dans le sol par des plantes qui n'ont pas de langage écrit pour consigner l'histoire pour leurs descendants.
Si l'on considère les dizaines de milliers d'années de souvenirs stockés sous nos pieds lorsque nous marchons sur le sol, la sensation de toucher le sol ne serait-elle pas nouvelle ?
--- p.84

La nature n'aime pas qu'un seul microbe domine.
Si un phénomène se produit au cours duquel un micro-organisme devient dominant dans notre organisme, nous ne pourrons plus survivre à cause de ce micro-organisme.
La plupart des agents pathogènes suivent ce chemin.
L'immunité humaine a une forte tendance à empêcher la multiplication rapide d'un seul micro-organisme.
Ainsi, les êtres vivants vivent en diversité, à une densité appropriée et en coopération les uns avec les autres.
La seule exception sur Terre, ce sont les humains.

--- p.92

Les plantes dégagent toujours une odeur.
Si l'on s'approche d'une plante avec un peu de délicatesse et que l'on approche son nez, on peut sentir son parfum unique.
Les tomates, qui dégagent une variété de parfums, en sont un exemple représentatif.

--- p.98

Il est bien connu que lorsque des plantes sont attaquées par des insectes, elles émettent une odeur pour avertir les plantes voisines et les préparer à l'avance.
L'odeur créée à ce moment-là est appelée « composé volatil végétal induit par les herbivores, HIPV ».
L'importance de notre étude réside dans le fait qu'elle démontre qu'un phénomène similaire peut se produire avec des micro-organismes.
Nous avons donc inventé le terme « composés volatils végétaux induits par les microbes (MIPV) » et l'avons utilisé pour la première fois dans notre laboratoire.
Désormais, les scientifiques menant des recherches similaires utiliseront ce mot.

--- p.101

Comment les plantes, contrairement aux animaux, perçoivent-elles les sons ? Elles n'ont ni tympans ni antennes.
Comment savoir si les plantes peuvent entendre ? Si l'on peut déceler la réaction des animaux en mouvement aux sons par leurs déplacements, comment savoir si les plantes immobiles perçoivent les sons ?
--- p.106~107

Si l'on pouvait ralentir la maturation des tomates grâce au son, les consommateurs pourraient percevoir cela comme une méthode respectueuse de l'environnement.
Un autre avantage est que cela ne coûte rien de plus.
En effet, Hertz n'a besoin de produire qu'un son mécanique constant, un « zing » régulier.
Tout ce dont vous avez besoin, c'est d'un haut-parleur.

--- p.110~111

Nous avons exposé des plants d'Arabidopsis dans une boîte silencieuse à un son continu de 10 kilohertz et 90 décibels pendant trois heures par jour pendant dix jours, puis nous avons arrosé les racines avec des bactéries pathogènes.
Généralement, au bout de 10 jours, les plantes commencent à montrer des symptômes de flétrissement, et au bout de 20 jours, elles se dessèchent et meurent toutes.
Cependant, dans le cas des plants d'Arabidopsis qui avaient été traités, même s'ils étaient malades, les symptômes étaient nettement moins importants, et il y avait aussi des plants d'Arabidopsis sains ne présentant pratiquement aucun symptôme de maladie.

--- p.115~116

Alors pourquoi les plantes perçoivent-elles les sons ? Dans la nature, on peut observer que les racines des pois poussent dans la direction du bruit de l’eau souterraine qui coule.
On a également observé que les racines du maïs réagissaient à des fréquences de 100 à 300 Hz et se déplaçaient et croissaient dans cette direction.

--- p.116

Des expériences ont montré que les plantes produisent des sons allant de 20 à 2 000 kilohertz.
L'eau est importante pour la croissance des plantes, mais elles émettent un son particulier lorsqu'il n'y a pas d'eau.
Plus les jours passaient sans arrosage, plus le bruit devenait fort et puissant.
Outre la sécheresse, elle émet également un son particulier lorsque ses feuilles sont coupées aux ciseaux ou lorsqu'elle est infectée par un virus.

--- p.118

Les plantes infectées par le phytoplasme présentent des symptômes caractéristiques.
Les symptômes courants incluent la mort, le flétrissement ou le jaunissement de la plante, mais les conséquences d'une infection par phytoplasme sont tout à fait différentes.
Au contraire, les feuilles deviennent plus luxuriantes.
Elle produit également un nombre excessif de feuilles pointues (ressemblant à des aiguilles de pin) au lieu de la forme typique des feuilles.

--- p.135~136

Se pourrait-il que de nombreux aspects de nos pensées (notre libre arbitre) soient contrôlés par des entités inconnues ? Ne devrions-nous pas considérer les microbes, et pas seulement les humains, comme faisant partie de notre espèce, et prendre en compte leur rôle dans nos actions et nos pensées ? En effet, les microbes existaient probablement bien avant l’être humain et ont vraisemblablement tenté de communiquer leurs expériences aux organismes multicellulaires de diverses manières.

--- p.137

Parmi les causes de la dépression figurent les toxines produites par la bactérie intestinale Clostridium.
Ainsi, si ces bactéries sont éliminées grâce aux antibiotiques, la dépression s'améliore.
En fin de compte, l'histoire raconte que l'une des causes des maladies mentales est un déséquilibre de la flore intestinale.
--- p.139

La découverte des antibiotiques par l'homme et l'émergence des superbactéries ne sont que des conséquences naturelles.
Comme les bactéries sont aussi des êtres vivants, elles tentent de survivre en modifiant leur ADN par des mutations (même si elles n'ont pas d'os) et en s'efforçant de traverser les os.
Pour l'instant, il semble donc qu'ils soient en train de gagner la bataille contre les humains.
Si les bactéries l'emportent complètement, l'humanité n'aura d'autre choix que de retourner à l'ère pré-antibiotique.

--- p.189

C’est véritablement un coup de chance que, grâce à mon observation attentive de l’événement improbable de l’évasion des larves de la teigne de la cire, j’aie découvert une enzyme capable de décomposer le plastique et même développé la technologie permettant de l’appliquer.
Avant tout, surmonter le syndrome du merle bleu, la conviction que ce qui se passe au laboratoire n'est pas séparé de moi mais pourrait être exactement ce que je recherche, a joué un rôle important dans la résolution du problème.
En science, des choses que l'on croyait n'être que de simples coïncidences sont inévitablement liées.

--- p.209

Pour confirmer nos résultats, nous avons réalisé des expériences supplémentaires en utilisant des bactéries tuées par la vancomycine isolées de la teigne de la cire.
Si la métamorphose s'accélère en l'absence de bactéries Gram-positives, l'introduction forcée d'un plus grand nombre d'entérocoques Gram-positifs pourrait-elle ralentir ce processus ? Or, l'ajout de bactéries Gram-positives isolées de l'intestin a retardé la métamorphose de 2 à 4 jours.
Il est intéressant de noter que l'introduction d'un bacille (connu sous le nom de bactérie du natto) dans l'intestin de la teigne de la cire, qui n'y avait pas été trouvé auparavant, a permis de retarder la métamorphose de la même manière.

--- p.234

Pour trouver les bactéries responsables de l'acné à l'intérieur des masques, nous avons décidé de vérifier les éléments de base un par un.
Nous avons cherché à savoir où vivent les bactéries comme le Staphylococcus aureus, qui provoquent des inflammations cutanées.
Elles résident profondément dans les follicules pileux de la peau, où elles se multiplient et produisent des toxines qui attaquent les cellules cutanées.
Les cellules de la peau tentent alors de tuer les bactéries en provoquant une inflammation pour résoudre le problème.
Au cours de ce processus, une réaction inflammatoire se produit au niveau de la peau : c’est ce qu’on appelle l’acné.
En tant que microbiologiste, ma première question a été : « Pourquoi ces bactéries se cachent-elles si profondément sous la peau ? »

--- p.245~246